專利名稱::檢測膀胱移行細胞癌的非侵入性體外方法
技術領域:
:本發明涉及一種通過尿分析來檢測個體的尿中的膀胱移行細胞癌的存在的非侵入性體外方法,以及衍生自所挑選的蛋白質的肽序列的用途和實現該方法的一種試劑盒。
背景技術:
:膀胱癌是最常見的尿道癌癥;它也是在男性中第四常見和在婦女中第八常見的癌癥。它包括很大范圍的多種組織學類型的腫瘤包括膀胱移行細胞癌(BTCC,90%),扁平上皮癌(7W,腺癌(2%)和未分化癌(1%)。腫瘤的等級和階段是BTCC的最佳預后指標。依照世界衛生組織(WHO)隨著分化狀態的減少和侵襲性的增加,膀胱腫瘤在細胞形態學上被分級為從Gl(低度惡性)到G3(高度惡性)。根據階段或浸潤性,BTCC類被分類為表面乳頭狀的(Ta和Tl),肌層浸潤性的(T2到T4),或不常見的原位癌或原位腫瘤(TIS)。低度惡性腫瘤通常被限制在黏膜或滲入表面層(Ta和Tl階段)。多數高度惡性腫瘤至少在Tl階段(侵入固有層)就被查出。大約75%被診斷的膀胱癌病例是在淺表的。剩余的25%在診斷時是肌層浸潤性的。淺表BTCC的患者預后良好,但是復發的風險有70%。盡管風險這么高,Ta腫瘤傾向于是低度惡性的,并且僅有10-15%在2年內將發展到肌層浸潤性的。然而發展到T2階段的Tl腫瘤的該百分比更高(30-50%)。目前,對個體的膀胱癌的最佳診斷系統是通過膀胱鏡檢察和尿道切片^r查法或是通過切除術,都以侵入性的過程為代表。可變形的膀胱鏡使技術的侵襲性較小,但它依然是侵入性的和高度令人不快的,仍然需要某種形式的麻醉。BTCC診斷的主要非侵入性技術是通過對尿中細胞進行形態檢查以鑒別新成型細胞。因此,目前用細胞學監測已確診的和經過治療的膀胱癌患者。雖然尿細胞學能檢測出膀胱鏡檢察不出的原位腫瘤,以及位于膀胱上端或尿道上部,即輸尿管、骨盆和腎臟的肺瘤,但是幾項研究表明,細胞學在膀胱癌診斷上的敏感性非常低,對50%的腫瘤漏診。細胞學的發現少,并且可能與易反應或退化過程相混淆。細胞學研究要求專家,單獨評估,這延遲了結果的可用性并且進一步導致主觀性和最后結果的分歧。實際上,還沒有可用于診斷膀胱癌的高靈敏度和特異性的非侵入性方法(BomanH.etal.,JUrol2002,167:80—83)。為了改進非侵入性的癌癥檢測已經做了許多努力。在腫瘤細胞表達鐠上的最新進展通過蛋白組技術、高分辨率二維電泳法和質鐠分析使識別作為膀胱癌的腫瘤標記的候選蛋白質成為可能,如核基質蛋白NMP22(SolowayM.S.etal.,JUrol1996,156:363-367),透明質酸和透明質酸酶(PhamHT.etal.,CancerRes1997,57:778—783),基底膜復合體(BTA,PodeD.etal.,JUrol1999,161:443—446),癌胚抗原(CEA,HalimA.B.etal.,lntJBiolMarkers1992;7:234-239),尿溶蛋白II(WuX.R.etal.,CancerRes1998;58:1291-1297),離散因子/肝細胞生長因子(SF/HGF,GohjiK.etal.,JClinOncol2000;18:2963-2971),角蛋白質/細胞角蛋白家族,如細胞角蛋白20(Buchumenskyv.etal.,JUrol1998,160:1971—1974),細月包角蛋白18(Sanchez-CarbayoM.etal.,ClinCa腦rRes2000,6:3585-3594),乳房肺瘤8—Ka蛋白(MAT-8,MorrisonB.W.,JBiolChem1995,270:2176—2182)和端粒酵(LeeD.H.etal.,ClinicalCancerResearch1998,4:535-538)。MemonA.A.等(CancerDetectPrev2005,29:249-255)確定了在膀胱癌的細胞系和切片中有七種差異表達的蛋白質。然而沒有使用對照做比較。Langbein,S.等(TechnolCancerResTreat2006,67-71)公開了用2D-PAGE和SELDI-T0F-MS技術的膀胱癌患者的切片檢查的蛋白譜。RasmussenH.H,等(JUrol1996,155:2113-2119)/〉布了存在于膀胱癌患者尿中表達最高的蛋白質的一個數據庫。CeNsJ.E.等(電泳法,1999,300-309)描述了存在于膀胱癌患者的切片檢查中蛋白質的一個數據庫。然而,因為作者沒有給出健康樣品對腫瘤樣品中蛋白質的定量差異圖語,在這些參考文獻中沒有一篇確定了標記。此外,沒有已在臨床試驗上被證明能用于預測膀胱癌的預后和程度的標記(MiyakeH.etal.,JUrol2002,167:1282—1287)。
發明內容本發明提供了一種涉及與BTCC相關蛋白質的高靈敏度,有效快速的非侵入性體外方法。它進一步涉及一種通過尿樣分析來診斷、預后和監視BTCC的方法。本發明出人意料地通過尿分析為BTCC的檢測提供膀胱癌生物標記。本發明的一種優選具體實施方式涉及通過尿分析檢測BTCC的40種膀胱癌生物標記,它們對BTCC的檢測、診斷、預后和監視有重要價值。氨基酰化酶-1(ACY1)是一種催化酰化L-氨基酸水解為L-氨基酸和酰基基團的細胞液同型二聚體的鋅結合酶,被假定在酰化氨基酸代謝分解和搶救中起作用。ACYl被確定為屬于染色體3p21.1,該區域減少小細胞肺癌(SCLC)的純質性,并且有報告它在SCLC細胞系和腫瘤中的表達減少或檢測不到。ACYl是鋅結合酶一個新家族的第一個成員。醛類還原酶(AKR1A1)屬于醛基/酮基還原酶家族,它涉及生物源的和外來的醛的減少并且實際上存在于每個組織中。醛縮酶B(ALDOB),也稱果糖1-磷酸酰醛縮酶,在肝臟、腎臟和腦中產生。它對于果糖的降解是必要的。a-淀粉酶(AMY)類癌,胰a-淀粉酶和a-淀粉酶1A屬于糖基水解酶13家族并且水解在低聚糖和多聚糖中的1,4-a-糖苦鍵,并且因此是催化飲食中淀粉和糖朊的消化的第一步。人的染色體有一個在唾液腺或胰腺中高水平表達的幾個淀粉酶基因的群。膜聯蛋白IV(AMA4)屬于鈣依賴性磷脂結合蛋白的膜聯蛋白家族。雖然它們的作用仍然不明確,膜聯蛋白家族的幾個成員在與膜相關的內吞和內吞通路中相關連。在上皮細胞中ANXA4幾乎被專有表達。載脂蛋白A-1(AP0A1)屬于載脂蛋白Al/A4/E家族,并且其參予了膽固醇排泄從組織到肝臟的反向運輸,并且這是通過其作為卵磷脂膽固醇酰基轉移酶(LCAT)的一個輔助因子而促進膽固醇從組織外流。膽綠素還原酶A(BIEA)屬于gfo/idh/moca家族和膽綠素還原酶亞族,并降低開放式四吡咯,膽綠素IXoc的y-亞甲基橋,其隨著NADH或NADPH的伴隨氧化作用被變為膽紅素。黃素還原酶(BLVRB)催化從還原的吡咬核苷酸到黃素以及亞甲藍、吡咯喹啉對苯二酮、核黃素或高鐵血紅蛋白的電子轉移。BLVRB可能是在保護細胞避免從氧化損傷或在調控的鐵代謝中的一個成員。在肝臟中,它將膽綠素轉換成膽紅素。它主要在肝臟和紅血球中表達,在心臟、肺、腎上腺和大腦中以較低的水平表達。組織蛋白酶D(CATD)是一種屬于肽酶Al家族的酸蛋白酶并激活細胞內蛋白質降解。它涉及幾種疾病發病原理例如膀胱癌(0zerE.,etal.,Urology199954:50-5andloachimE.,etal.,AnticancerRes2002,22:3383—8)乳&泉癌,還可能涉及老年癡呆癥。組織蛋白酶D被合成為一個不活潑的52kDa的前體,由二個14kDa(CATDH)和一個34kDa(CATDK)的多肽形成。不活潑的肽通過N-末端的解朊作用激活形成48kDa酶化活if夭蛋白質。補體C3前體(C03)在補體系統的活化中起到關鍵作用。其通過C3轉化酶的處理是兩條補體通路中的關鍵反應。C03與尿殖腫瘤有關(DunzendorferU.,et.al,EurUrol1980,6:232-6)。細胞液非特異性的二肽酶(CPGL1)屬于肽酶M20A家族并且也稱為組織力幾肽酶和肽酶A。它是非特異性的二肽酶而不是一種有選擇性的肌肽酶。a-烯醇化酶(ENOA)是一種多功能的酶,它也在多種過程例如生長控制,耐缺氧和過敏反應的糖酵解中起到一部分作用。它在血管內和細胞周圍的纖維蛋白溶解酶系統中可能也起作用,由于它能作為幾種細胞類型如白血球和神經元的細胞表面的受體和纖溶酶原活化劑。哺乳動物的烯醇化酶由3個同工酶亞基,a,P和Y組成,能形成細胞型且非特異性發展的同型二聚體或異型二聚體。ENOA與神經細胞質膜上的PLG的相互作用并促進它的活化。它^皮用作許多腫瘤的一個診斷標記,并且,其異型二聚體形式,a/v,作為心臟驟停后缺氧腦傷的一個標記。它與膀胱癌有關(lczkowskiLA.,et.al,病理組織學,1999,35:150-6)。鐵蛋白輕鏈(FRIL)屬于鐵蛋白家族并且是在原核生物和真核中主要的細胞內貯存鐵的蛋白質。它由24個亞基的重的和輕的鐵蛋白鏈組成。在鐵蛋白亞基構成上的變化能影響不同組織的鐵吸收率和釋放率。鐵蛋白的主要功能是在可溶的和無毒的狀態下貯存鐵。RabGDP解離抑制劑p(GDIB)屬于rabgdi家族并調控rab家族成員的GDP/GTP交換反應,ras超級家族的小GTP結合蛋白,涉及細胞器之間的分子膜泡運輸。GDIB被普遍表達。血漿谷胱甘肽過氧化物酶(GPX3)屬于谷胱甘肽過氧化物酶家族并通過還原的谷胱甘肽催化過氧化氫、有機氬過氧化物和油脂過氧化物的還原反應并起到保護細胞對抗氧化損傷的功能。人的血漿谷胱甘肽過氧化物酶被證實是一種含竭的酶。GPX3表達顯示出組織特異性。谷胱甘肽合成酶(GSHB)對許多生物功能是重要的,包括保護細胞免受來自自由基的氧化損傷,對外來異物的解毒和膜轉運。凝溶膠蛋白(GSN40和GSN80)是一種鉤調控的,調整肌動蛋白的蛋白質,結合在肌動蛋白單體或細絲的正末端,防止單體交換(端基封閉或加帽反應)。它能促進單體裝配入細絲(成核現象),也能切斷現有的細絲。另外,該蛋白質結合在肌動蛋白和纖維連接蛋白上。雖然它未被描述為生物標記,即,它在健康個體中的表達水平未被比較并且未被對癌癥患者定量,但是它已與膀胱癌相l關系(Rasmussen,H.H.etal.,JUrol1996,155:2113—2119;HagaLHokkaidolgakuZasshi2003年,78:29-37;CelisAetal.,Electrophoresis1999,20:355-61)。谷胱甘肽硫轉移酶(GSTP1)屬于通過催化許多疏水和親電的化合物與還原型谷胱甘肽結合而成為解毒中一個重要角色的一個酶家族。細胞質異檸檬酸鹽脫氫酶(IDHC)屬于異杵檬酸鹽和異丙基蘋果酸脫氬酶家族并且催化異檸檬酸鹽的氧化去羰基形成a-酮戊二酸鹽。膜泡整蛋白VIP36前體(LMAN2)是細胞內凝集素的早期分泌通路中一個角色。與N-乙酰基-D-半乳糖胺和高甘露糖型聚糖相互作用,并且也可結合到0-連接的聚糖。它涉及高甘露糖類聚糖的糖蛋白的轉運和排列。淋巴細胞抗原6復合體,位點6G6E(LY6G6E)屬于淋巴細胞抗原6超級家族。這個家族的成員富含半胱氨酸,通常為GPI錨定的細胞表面蛋白,有確定的或想象的免疫相關作用。它的特定功能是未知的。甘露聚糖結合的凝集素絲氨酸蛋白酶2,前體(MASP2)屬于肽酶sl家族并且據推測在甘露糖結合凝集素的胰蛋白蛋白酶(MBL)補體活化功能通路的啟動中扮演一個重要的角色。在活化后它乂人C4裂解為C4A和C4B。尼克酰胺乙酰乙酸水解酶(MDC)屬于nadC/modD家族并且是從色氨酸到NAD的從頭合成通路中的一個中介,并且是通過神經元中N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受體的超刺激的一種潛在的內生興奮毒素。大腦中NADC水平的升高與神經退^f于性失調如癲癇癥、老年癡呆癥和亨廷頓病的發病才幾理相關。它還未與癌癥相l關系。NapsinA(NAPSA)屬于肽酶al家族并且它在腎臟中以最高水平表達,在肺中以適度水平表達并且在脾臟和脂肪組織中以低水平表達。它可能涉及肺細胞表面活化劑前體的處理。增生擴散相關蛋白質2G4(PA2G4)是在核定位時顯示細胞周期特異性變化的單鏈DNA結合蛋白質,屬于肽酶m24c家族。當蛋白質在回應有絲分裂原刺激下表達時,它可能屬于維護增生擴散細胞的細胞周期活動的細胞周期管理蛋白質或復制蛋白質的一個大家族。致癌基因DJ1(PARK7)在胰腺、腎臟、骨骼肌、肝臟、睪丸和心臟中被高度表達并且對雄激素受體依賴的轉錄起到正調節。它能作為氧化還原功能敏感型伴侶和作為氧化壓力的傳感器。它防止SNCA的聚合并且保護神經元以防氧化壓力和細胞死亡。多(rc)-結合蛋白1(PCPB1)是優選與低聚dC結合的單鏈核酸結合蛋白。它能在細胞核和細胞質之間穿梭。它在骨骼肌、胸腺和外周血液白細胞中大量表達,在前列腺、脾臟、睪丸、卵巢、小腸、心臟,肝臟,腎上腺和曱狀腺中所觀察到的表達較低。程序性細胞死亡6相互作用蛋白(PDC6I)在腦、心臟、胎盤、肺、腎臟、胰腺、肝臟、骨骼肌和耳蝸中被表達,并且可能在凋亡和細胞增殖的調節中扮演一個角色。它與PDCD6/ALG-2和SH3KBP1相互作用。溶酶體酸性磷酸酶前體(PPAL)屬于組氨酸酸性磷酸酶家族并且水解正;粦酸的單酯為醇和磷酸鹽。抗氧化蛋白2(PRDX2)屬于ahpc/tsa家族并且涉及細胞的氧化還原調節。它通過還原硫氧還蛋白系統提供的等同物來還原過氧化物。它不能從谷氧還蛋白接受電子。它在消滅新陳代謝時產生的過氧化物中可能扮演一個重要角色。它能通過調控細胞內的H202濃度參與增長因子和ot-腫瘤壞死因子的信號發生的聯級反應。它能提高天然殺傷(NK)細胞的活性。谷氨酰胺酰肽環轉移酶(QPCT)對焦谷氨酰肽生物合成負責。它偏向酸性并且在谷氨酸N末端附有色氨酸殘基。血漿維生素A結合蛋白質(RETBP)屬于淚液蛋白家族并且是維生素A的(維生素A醇)在血液中的特異性載體。它將肝臟貯存的維生素A運送到外周組織。血漿中RBP維生素A復合體與甲狀腺素蛋白相互作用,以防止它通過腎臟小球時過濾的損失。維生素A的缺乏阻礙了翻譯后結合蛋白的分泌并且導致了其對表皮細胞的傳輸和供應的缺乏。硒結合蛋白質(SBP1)屬于硒結合蛋白質的家族。硒是一種顯示出潛在抗癌特性的基本營養素;硒的缺乏可能導致某些神經疾病,有人提出硒在防止癌癥和神經疾病上的功能也能由硒結合蛋白調節。磷酸化應激誘導蛋白1(STIPl)是調節分子伴估HSC70和HSP90(HSPCA和HSPCB)的結合的一種4妄頭蛋白。轉醛醇酶(TALDO)屬于轉醛醇酶家族并且是為核酸合成提供核糖-5-磷酸鹽以及為油脂生物合成提供NADPH的非氧化性戊糖磷酸鹽通路的一種關鍵酶。這條通路也能維護還原狀態的谷胱甘肽進而在氧自由基下保護巰基基團和細胞的完整性。甲狀腺素蛋白(TTHY,舊稱前白蛋白)是脊推動物血液中發現的3種曱狀腺激素結合蛋白質之一。它產生于肝臟并在血液中循環,在那兒它與維生素A和甲狀腺素相結合。WD重復蛋白1(WDR1)屬于wd重復aipl家族并且與ADF/絲切蛋白家族蛋白質一起導致肌動蛋白細絲的解聚。癌癥可以通過分析測試尿樣中的至少一種膀胱癌生物標記的表達才莫式而查出。因此,檢測尿檢樣品中的至少一種差異表達的蛋白質并與正常尿比較可用來指示BTCC。尿液樣品的組成差異很大。所以,為了計算總蛋白含量的不同和消除樣品與樣品之間的偏差,標準化是關鍵。在尿中含量恒定的對照蛋白質的表達水平,可由于信號水平的標準化。文獻中有許多這些非易變蛋白質的例子。在本發明中,鐵傳遞酶顯示為非易變蛋白質。本發明中識別代表性膀胱癌的蛋白質或生物標記包括,但不限于TTHY、ACY1、AKR1A1、ALD0B、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP(也在40種膀胱癌生物標記中被提到)。本發明一方面涉及一種非侵入性的體外方法,包括a)檢測和定量存在于一個來自個體的尿檢樣品中的一種或多種生物標記;和b)比較a)中測試尿樣得到的表達測量值與正常尿的對應標準值,其中a)中得到的測量值與正常尿的對應標準值相比的變化指示了BTCC。該方法適用于檢測BTCC的存在,4企測這種癌癥的階|殳或嚴重程度的篩選。此外,該方法也被用于外科切除術后估計疾病的缺乏,建立這種癌癥診斷和預后和/或監測對患有這種癌癥的個體給藥的治療效果。發明另一方面涉及應用一種或多種來源于尿中存在的生物標記的肽序列,通過尿分析檢測BTCC的存在,確定這種癌癥的階4爻或嚴重程度,在外科切除術后估計缺乏疾病,建立該癌癥診斷和預后和/或監測對患有所述癌癥的個體給藥的治療效果。發明另一方面涉及應用一種或多種來自40種膀胱癌生物標記的核苷酸或肽序列,或它們的轉錄或翻譯前的產物,單獨或任意結合,用篩選的方式來鑒別,發現并評估治療BTCC的藥物。發明還提供了直接針對這種膀胱癌生物標記的抗體。這些抗體能以適用于一種特殊用途的多種形式被提供,包括,例如,以可溶的形式,固定在基質上,或與一種藥學上可接受的載體相結合。發明另一方面涉及前定義的執行該方法的試劑盒包括l)至少一種尿中的癌癥生物標記的特異性識別抗體和2)—種適于包裝的載體。發明另一方面涉及與BTCC參考表達諳,包括一種或多種膀胱癌生物標記表達的^t式。不同的BTCC參考表達譜可能建立并可能與不同的癌癥階段相關。本發明目的使用了以下定義術語"癌癥"是指以異常或無序的細胞成長為典型特征的,能夠侵略相鄰組織并傳播到遠處器官的疾病。術語"癌"是指由異常或無序的細胞長成的組織。術語"過渡膀胱細胞癌"或它的簡稱"BTCC"是指其中任一種在膀胱上皮細胞中惡性增生性的失調。術語"腫瘤"是指一種從新塑造過程引起的任何組織的異常大量增生,不論它是良性的(非癌)或惡性的(癌)。術語"膀胱癌蛋白質或生物標記,,是指有在BTCC中差異表達的蛋白質,即,來自一個健康個體的尿的與來自一個BTCC患者的尿的相比在表達上的不同的蛋白質。本發明中包括的差異表達的蛋白質組中的蛋白質,包括選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALD0B、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、E醒、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP的所有40種生物標記,還有當二種不同尿樣,一種來自一個健康個體且一種來自移行細胞癌的患者,相比較時,比率變化至少為二倍的尿樣中任何蛋白質量化使用了圖像分析軟件如ProgenesisPG220軟件。這里描述的膀胱癌生物標記可以是任意長度的并進一步包括從原生蛋白質獲得的附加序列和/或異種序列,任何轉錄的或轉錄后的變異,以及所有與所述序列有至少95%同一性的序列,其中同一性被定義為二個字列之間殘基相同的百分比。那些本領域普通技術人員所知的這些其它部分或變異也可用于癌癥的治療和檢測中。術語"測量一種或多種生物標記"意味確定一種或多種生物標記的存在,然而術語"定量一種或多種生物標記"意味一種或多種生物標記表達存在的值(例如作為強度值)。術語"BTCC的指示"意味著在測試尿樣中一種或多種生物標記的測量中找到的變異與正常尿對應的標準值相比作為BTCC存在的證明。術浯"變異,,是指在蛋白質的表示上的水平的一個變化。術語"差異表達的蛋白質"是指BTCC患者的尿與一個健康個體尿相比有變化(增加或減少)的蛋白質。術語"倒轉表達"是指二種表達模式相反的差異表達的蛋白質(即,當在樣品中一種過度表達時另一種被抑制,反之亦然)。術語"蛋白質提取物"對應于尿樣在離心后得到的上清液。術語"個體"是指哺乳動物類的所有動物種類并且包括,但是不限于,家畜和牲口、靈長類和人,并優選是指所有年齡或種族的一個雄性或雌性。術語"健康個體"是指一個未得BTCC的人,也可能包括其他泌尿道疾病的患者。術語"以前被診斷的"是指一個已經收到了BTCC的肯定診斷的人。術語"以前未被診斷的"與從未收到了BTCC的肯定診斷(重新診斷)的人。術語"正常尿中的標準值"是指在已知未患BTCC的個體的單獨尿樣測量一種或多種生物標記的平均表達水平的量化。術語BTCC的"診斷"是指通過評估一種或多種BTCC生物標記來辨認或確定BTCC的種類和起因的過程。術語"預后"是指疾病的可能結果,即痊愈或復發的可能性。術語"監測"意味在不同時間個體中BTCC存在或不在的評估。術語"治療"是指所有直接或間接的過程、行動、應用或類似物,其中個體是在醫療幫助下改善他的情況。術語"特異性"是指當疾病實際上不存在時,一種測試排除疾病的存在的能力。特異性被表示為有正確的否定測試結果的健康個體的數量(這個小組稱為真陰性組),除以真陰性和有不正確的肯定測試結果的健康個體的數量(這個小組稱為假陽性組)的總和。術語"敏感性"是指當疾病真實地存在時,測試查出疾病的能力。^t感性被表示為有正確的肯定測試結果的患病的患者的數量(這個小組稱為真肯定組),除以真肯定組和有不正確的否定測試結果的患病的患者的數量(這個小組稱為假否定組)的總和。術語"穩定性"定義了數字表示方法盡管最初樣品發生了變異仍能提供同樣結果的能力。術語"基因"是指編碼蛋白質的脫氧核苷酸分子鏈的一個區域,并且可能代表編碼序列的一部分或一個完整的編碼序列。術語"蛋白質"是指分子間通過共價或非共價鍵連接的至少一條氨基酸分子鏈。該術語包括所有翻譯后蛋白質修飾的所有形式,如糖基化、磷酸化或乙酰化。術語"肽"和"多肽"是指蛋白質片段的氨基酸分子鏈。術語"蛋白質"和"肽"是難以區分的。術語"抗體,,是指回應抗原刺激而被分泌入血液或淋巴的,并且顯示出和稱作"抗原"的目標分子的特異性結合活性的B細胞表面的一種Y形蛋白質(叫作免疫球蛋白),抗原如一種外來的蛋白質、細菌、病毒、寄生生物或被移植的器官。免疫球蛋白的抗原結合區域可以被劃分成F(ab')2或Fab片段。術語"抗體',包括單克隆和多克隆抗體,和來自它們的完整個體或片段;還包括人的抗體、人源化的抗體和非人源化的抗體。"非人抗體"是指除人類外的動物種類產生的抗體。"人源化抗體,,是將鼠抗體中最小的鼠源部位熔合在人的抗體上的基因工程抗體。通常,人源化抗體5-10%來源于老鼠和90-95%來源于人。"人的抗體"是抗體獲得從運載人的抗體基因的基因改造的老鼠或從人類細胞。"單克隆抗體"是同種的,直接針對一個唯一抗原位點或"決定部位"目標分子的高度特異性抗體種類。"多克隆抗體"包括異種的,針對不同的抗原決定的目標分子的抗體種類。術語"特異性抗體"是指所產生的針對特異性蛋白的抗體(在這種情況下針對一種特殊膀胱癌標記)。術語"抗體蛋白質復合體"是指抗原和它的特異性抗體形成的復合體。術語"組合體"(組合抗體)是指在纖維狀噬菌體上顯示的抗體,允許cDNA庫直接篩選細胞表面易反應抗體的表達,抗體的生產和純化不需要使用細菌或真核狀態的細胞系統。術語"Fab重組抗體"是指只包含單價的Fab片段的重組抗體,抗體對其抗原時有非常高的親合力。如果知道蛋白質序列,它們可由細胞重組獲得。術語"ScFv抗體片段"是指可用細菌培養表達的一個單鏈易變的片段(scFv)。術語"表位"是指蛋白質的一個抗原決定部位,是特異性抗體識別蛋白質的氨基酸序列。這些表位也許包括相鄰分枝的氨基酸(線性表位)或由于多縮氨基酸鏈的三維折疊被帶入而接近的不相鄰的氨基酸(不連續的表位)。術語"固相"是指抗體可結合的一種非水的基質。固相材料的例子包括,但是不限制于玻璃、多聚糖(例如瓊脂糖),聚丙烯酰胺、多苯乙烯、聚乙烯醇和硅。固相形式的例子是平板的孔或凈化柱。術語"試紙,,是指浸入液體以確定和/或定量液體的一些特性(化學的,物理的,等等)的一個測試設備。這種試紙通常由紙或紙板制成并用以顏色變化指示某些特性的液體浸透。術語"載體"是指用于運栽或傳遞某些物品的一個機械或設備。術語"包裝"是指在銷售前以產品的購買和使用為根本目的包裹和裝入。術語"生物芯片"是指為了達到更高的生產量和速度的,能使許多測試同時執行的排列在固體物質上的小型化的測試位點的集合。在發明的一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量來自個體的一個尿檢樣品中的一種或多種生物標記,其選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALD0B1、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL1、GDIB、GPX3、GS服、GSTP1、歷C、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1、AMY、AP0A1、GS詣、GSN80和RETBP(也指40種膀胱癌生物標記)或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量來自個體的一個尿4企樣品中的一種或多種生物標記,其選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALD0B、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO和WDR1或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的笫一步包括檢測尿枱r樣品中至少二種生物標記或其中的一個轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括檢測尿檢樣品中至少三種生物標記或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括檢測尿檢樣品中至少四種生物標記或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括檢測尿檢樣品中至少五種生物標記或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中一種或多種生物標記,其選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、I匿、LY6G6E、MSP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP或其轉錄或翻i奪后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中一種或多種生物標記,其選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LY6G6E、駄SP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1和STIP1或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿;^樣品中一種或多種生物標記,其選自TTHY、CATDHl、CATDK、ENOA、FRIL、GSHB、GSTP1、IDCH、MASP2、PRDX2、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中一種或多種生物標記,其選自TTHY、CATDH、CATDK、EN0A、FRIL、GSHB、GSTP1、IDCH、MASP2和PRDX2或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中一種或多種生物標記,其選自TTHY、AMY、AP0A1、GSN40和GSN80或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中AP0A1和RETBP或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中AMY、AP0A1和GSN40或其轉錄或翻i奪后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿^r樣品中AMY、AP0A1和ENOA或其轉錄或翻i奪后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿^r樣品中AP0A1、GSN40和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括在測量尿檢樣品中CATDK、GSN80和IDHC或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中AMY、AP0A1、GSN40和IDHC或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中AP0A1、GSN40、GSN80和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中CATDH、ENOA、GSTP1和PRDX2或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中CATDK、EN0A、PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中AMY、CATDK,EN0A、IDHC和PRDX2或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和TTHY或其轉錄或翻i奪后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中CATDH、ENOA、GSTP1、MASP2、PRDX2和TTHY或其轉錄或翻;奪后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中AMY、AP0A1、CATDK,ENOA、IDHC、PRDX2和TTHY或其轉錄或翻i奪后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿^t全樣品中一種或多種生物標記,其選自AMY、AP0A1、GSN40、GSN80或其轉錄或翻譯后的變異,和一種或多種生物標記,其選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALDOB、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、E歸、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、,C、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1和RETBP,或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量尿檢樣品中一種或多種生物標記,其選自AMY、AP0A1、GSN40、GSN80或其轉錄或翻譯后的變異,和一種或多種生物標記,其選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALDOB、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、擺C、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO和WDR1或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量一種或多種生物標記,其選自CATDH、CATDK、EN0A、GSHB、GSTP1、IDHC、PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異,和一種或多種生物標記,其選自ACY1、AKR1A1、ALD0B、ANXA4、BIEA、BLVRB、C03、CPGL1、FRIL、GDIB、GPX3、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1、AMY、AP0A1、GS詣、GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,膀胱癌評估方法的第一步包括測量一種或多種生物標記,其選自TTHY、CATDH、CATDK、ENOA、GSTP1、IDHC、MASP2、PRDX2、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后的變異。另一個具體實施方式涉及一種非侵入性的體外方法,其包括定量兩種不同的生物標記之間的一個或多個比值,其選自來自個體的尿抬r樣品的40種膀胱癌生物標記或與其相關的轉錄或翻"i奪后的變異,并且將尿4全樣品所得的測量值與正常尿的相對應的標準值相比,其中的變化指示BTCC。在另一個具體實施方式中,方法允許比較得自同一病人在BTCC進程的不同時間的不同樣品中的同樣一種或多種蛋白以確定疾病的進程。在另一個具體實施方式中,一種或多種發明的生物標記也可被用于監測藥物或手術治療的效果。在另一個具體實施方式中,被分析的樣品得自以前未被診斷為BTCC的個體。在另一個具體實施方式中,被分析的樣品得自以前被診斷為BTCC的個體。在另一個具體實施方式中,4皮分析的樣品得自目前正在接受治療對抗BTCC的個體。在另一個具體實施方式中,方法包括得到樣品的蛋白質提取物。檢測典型地包括光譜法或免疫測定法。光譜法是典型地表面增強的激光解吸附或電離(SELDI)質語法/矩陣協助的激光解吸附/電離(MALDI)質譜法。免疫測定法包括免疫印跡、ELISA(酶聯免疫吸附分析),RIA(放射免疫分析),竟爭性EIA(竟爭性酶免疫分析),DAS-ELISA(雙重抗體夾心ELISA),免疫細胞化學或免疫組織化學的技術,根據生物芯片或包括特異性抗體的蛋白質微矩陣應用的技術,根據膠質金沉淀以例如試紙的形式的分析,或通過親合色i普法技術、配基結合分析或凝集素結合分析。在另一個具體實施方式中,癌癥檢查方法包括與一種膀胱癌生物標記特異性結合的分子與尿樣接觸并對這種結合定量。在另一個具體實施方式中,蛋白質的檢測和量化包括第一步,其中樣品蛋白質提取物依靠蛋白質或蛋白質的一個或更多表位與一種或多種特異性抗體相接觸,和第二步,定量抗體和蛋白質形成的復合體。在另一個具體實施方式中,用于檢測蛋白質的特異性抗體是人源的,人源化的或非人源的,和選自單克隆或多克隆抗體,抗體的整個或重組片段、組合抗體和Fab或scFv抗體片#爻。另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列,其衍生自選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALD0B、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1、AMY、AP0A1、GS詣、GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后的變異的生物標記,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列,其衍生自選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALDOB、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO和WDR1或其轉錄或翻譯后的變異的生物標記,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自癌癥生物標記的一種或多種肽序列的使用,并且將尿檢樣品所得的這些生物標記的測量結果與正常尿的相對應的標準值相比,其中的變化指示BTCC。在另一個具體實施方式中,至少使用了二種尿中的生物標記或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,至少使用了三種尿中的生物標記或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,至少使用了四種尿中的生物標記或其轉錄或翻譯后的變異。在另一個具體實施方式中,至少使用了五種尿中的生物標記或其轉錄或翻譯后的變異。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后的變異的生物標記,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1和STIP1或其轉錄或翻i奪后的變異的生物標記,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自選自TTHY、CATDH、CATDK、ENOA、FRIL、GSHB、GSTP1、IDCH、MASP2、PRDX2、AMY、APOAl、GSN40、GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后的變異的生物標記,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自選自TTHY、CATDH、CATDK、ENOA、FRIL、GSHB、GSTP1、IDCH、MASP2和PRDX2或其轉錄或翻譯后的變異的生物標記,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自選自TTHY、AMY、AP0A1、GSN40和GSN80或其轉錄或翻譯后的變異的生物標記,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自AP0A1和RETBP或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自AMY、AP0A1和GSN40或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自AMY,AP0A1和ENOA或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及書t生自AP0A1、GSN40和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自CATDK、GSN80和IDHC或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及書亍生自AP0A1、GSN40、GSN80和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自AMY、AP0A1、GSN40和IDHC或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自CATDH、ENOA、GSTP1和PRDX2或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及書f生自CATDK、EN0A、PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一具體實施方式涉及衍生自組Y、CATDK、EN0A、IDHC和PRDX2或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一具體實施方式涉及書t生自AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自CATDH、ENOA、GSTP1、MASP2、PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及衍生自AMY、AP0A1、CATDK、ENOA、IDHC、PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后的變異的肽序列的使用,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自的生物標記選自AMY、AP0A1、GSN40和GSN80或其轉錄或翻譯后的變異,和一種或多種肽序列,其衍生自的生物標記選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALDOB、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1和RETBP或一個其在轉錄或翻譯后的變異,其中生物標記在尿中存在。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自的生物標記選自AMY、AP0A1、GSN4Q和GSN8G或其轉錄或翻譯后的變異,和一種或多種肽序列,其衍生自的生物標記選自TTHY、ACY1、AKR1A1、ALDOB、ANXA4、BIEA、BLVRB、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、ENOA、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTPl、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PRDX2、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO和WDR1或其轉錄或翻譯后的變異,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自的生物標i己選自CATDH、CATDK、ENOA、GSHB、GSTP1、IDHC、PRDX2和TTHY或一個其在轉錄或翻譯后的變異,和一種或多種肽序列,其衍生自的生物標記選自ACY1、AKR1A1、ALDOB、ANXA4、BIEA1、BLVRB、C03、CPGL1、FRIL、GDIB、GPX3、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、PTD012、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP或一個其在轉錄或翻譯后的變異,其中生物標記存在于尿中。發明的另一個具體實施方式涉及一種或多種肽序列的使用,其衍生自的生物標記選自TTHY、CATDH、CATDK、ENOA、GSTP1、IDHC、MASP2、PRDX2、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP或一個其在轉錄或翻譯后的變異,其中生物標記存在于尿中。另一個具體實施方式涉及實施前面定義的方法的一種試劑盒,包括1)特異性識別一種或多種這些蛋白的抗體組合2)—種適合包裝的載體,用于檢測BTCC存在,確定該癌癥的階段或嚴重程度,評估外科切除術后疾病缺乏,建立該癌癥診斷和預后和/或監測對患有所述癌癥個體的治療效果的試劑盒。試劑盒可從包括裝入至少一種結合尿樣中所存在的一種生物標記的試劑的一個容器;和至少一種檢測BTCC狀態的至少一個試劑的說明書。該試劑盒可包括一個載體、包裝或容器,其用以分區接受一個或多個容器例如小瓶,管,等等,每一個容器含有該方法中單獨使用的元素。例如,容器可包含被標記和進一步被檢測的探針。探針可分別對膀胱癌蛋白質或膀胱癌基因有特異性的抗體或多聚核苷酸。或者,試劑盒可能包括一根質譜分析(MS)探針。試劑盒也可能包括包含使目標核酸序列擴增或沉默的核苷酸的容器,和/或容器包含記錄含意,例如生物素結合蛋白質,即,抗生物素蛋白或鏈霉親和素,結合著一個可檢測的標記,即,一種酶,螢光或放射性同位素標記的區域。試劑盒可能包括全部或部份的膀胱癌生物標記的氨基酸順序,或編碼這樣的氨基酸順序的一個核酸分子。發明的試劑盒典型地將包括上述容器和包括一種或多種滿足商業和用戶立場的材料的其他容器,包括緩沖液、稀釋劑、過濾器、針、注射器和帶使用說明書的包裝內容物。此外,容器上提供的標簽表明組合物用于一種具體治療或非治療的應用,也可表明如上所述的那些使用的指導。指導和或其他信息也可能被包括在試劑盒的內容物中。另一個具體實施方式涉及實施前面定義的方法的一種包括生物芯片的試劑備jnL。另一個具體實施方式涉及實施前面定義的方法的一種包括生物芯片的試劑盒,其中生物芯片包含檢測選自40種膀胱癌生物標記或其轉錄或翻譯后的變異的一種或多種生物標記的抗體。有許多免疫學分析可用于試樣檢測和/或定量特異性抗原-抗體復合體的形成;前面已描述了眾多的竟爭性或非竟爭性的蛋白質結合分析,并且這些中很多是買得到的。因此,定量蛋白質的抗體可以是,例如單克隆抗體、多克隆抗體,其完整或重組的片斷,對蛋白質有特異性的組合抗體和抗體的Fab或scFv片段。這些抗體可以是人源的,人源化的或動物源的。另一方面,它們是被標記的或未被標記的,并可用于許多種的分析。可被用于標記抗體的標記分子包括放射性核素、酶、熒光團、化學發光試劑、酶基體或輔助因子、酶抑制劑、微粒、染料和衍生物。抗體結合特異性越高,能檢測出抗原的含量越低。那些本領域普通技術人員所知的許多種分析可用于本發明,使用未被標記的抗體(主要抗體)和被標記的抗體(次要抗體);這些技術包括,但是不限于免疫印跡或免疫轉移,ELISA(酶聯免疫吸附分析),RIA(^:射免疫測定),竟爭EIA(竟爭性酶免疫測定法),DAS-ELISA(雙重抗體-夾心ELISA),免疫細胞化學和免疫組織化學技術,才艮據生物芯片或包括特異性抗體的蛋白質微矩陣應用的技術,或膠體沉淀的形式例如試紙。其他檢測和/或定量蛋白質的方式包括親合色鐠技術、配合基結合分析或凝集素結合分析。發明在這方面優選的具體實施方式是蛋白質微矩陣和雙重抗體夾心ELISA(DAS-ELISA)。在這些免疫測定法中能^f吏用任何特異性針對發明的40種蛋白質的一種或多種表位的抗體,或抗體的組合。例如該分析的許多可能的格式之一,識別發明的40種蛋白質的一種或多種表位的單克隆或多克隆的抗體,或該抗體的片段,或這些抗體的組合被附著在固相支持的表面并與樣品放置相接觸以進行分析,在特定時間孵育,在適當的條件下形成抗原-抗體復合物。用適當的條件清洗以去除非特異性的復合物后,一種指示試劑,存在于識別發明的40種蛋白質的一種或多種表位的單克隆或多克隆的抗體、或該抗體的片段、或這些抗體的組合中,與一個信號發生分子相連4妄,在適當的時間和溫度條件下與抗原-抗體復合物孵育。樣品中選自發明的40種蛋白質的一種或多種蛋白質的存在以對檢測定量和產生測定信號。為了防止由于樣品中總蛋白濃度的不同引起的信號變異,所有測量被標準化。如上所示,發明的方法包括通過特異性抗體定量尿樣中的差異表達的可溶蛋白質來監測膀胱癌的階^a。那些本領域普通技術人員會能使用所有特異性識別和定量這些蛋白質的手段來完成。在下面的描述中,公開了獲得和分析人尿樣(在此被稱為樣品)的總蛋白含量的常規方法。方法涉及樣品處理,使用2D電泳法分離在樣品內的蛋白質,通過圖像分析和統計不同的樣品的方式選擇差異表達的蛋白質,以及使用一種或多種發明的差異表達的蛋白質以產生蛋白質特異性抗體作為膀胱癌標志。在從健康個體得到的樣品(對照)和被診斷為BTCC(Ta、Tl-低度惡性,Tl高度惡性和T2)的患者之間為嘗試識別在膀胱癌各階段和在膀胱癌進展期中的差異表達蛋白質進行了比較蛋白質組分析。在所有顯示差異表達的蛋白質中,40種蛋白質可再生地改變超過了二倍。使用質譜分析和數據庫搜索,通過肽質量指紋圖語識別了它們。圖1:從尿樣得到二維電泳(2D)凝膠并顯示四個不同的研究區域A、K、R和S(圖1A),區域A(圖lg),區域K(圖1C),區域R(圖1D)和區域S(圖1E)。圖2:二維電泳法(2D)凝膠的區域R中對應BIEA的斑點R211,得自一個健康個體尿樣(圖2A),患癌癥的在Ta階段患者的(圖2B),患癌癥的在Tl低度惡性階段患者的(T1-LG,圖2C),患癌癥的在T1高度惡性階^R患者的(Tl-HG,圖2D)和患癌癥的在T2階段患者的(圖2E)。圖3:在樣品CV、Ta、T1低度惡性(T1-LG),Tl高度惡性(T1-HG)和T2中斑點R211的強度。每個小組的樣品數量如括號內所示。圖4:不同尿樣中斑點R211的強度檢測的穩定性。這被表示為在被分析的每塊凝膠中持續出現或缺少斑點R211的凝膠的百分比。每個小組的樣品數量如括號內所示。具體實施例方式本發明將由以下例子進一步說明。這些例子僅是舉例證明并不被解釋為限制。I.差異表達蛋白質的識別識別隨膀胱癌進展而差異表達的蛋白質,將健康尿的蛋白語與使用一種蛋白組方法的早期階段和發展期的膀胱胂瘤患者的那些圖語相比較。尿液樣品(總計150個)收集自前往屬于西班牙公共衛生網絡醫院的泌尿科的健康個體和有過渡膀胱癌的病人。這些樣品被分類如下a)沒有癌(63個樣品)包括-對照(CV,32個樣品)曾有膀胱癌,但已經切除了肺瘤的和已得到控制的患者(膀胱鏡檢察沒有顯示其他病變)。-有其他泌尿系統疾病的患者(31個樣品,包括在其他前列腺良性增生,前列腺癌)。b)BTCC(87個樣品)患者診斷按疾病在不同的發展階段包括-Ta(21個樣品)-Tl-低度惡性(29個樣品)-Tl-高度惡性(19個樣品)-T2(18個樣品)BTCC組的樣品所伴隨的切片檢查是它們在膀胱癌的發展階段分類的關鍵。A.尿樣處理和蛋白質分離。尿樣冷凍于-80°C并被放在干冰中運到實驗室,不需要打開冷凍系統。樣品被保存在-80°C,直到它們被處理。樣品非常不同,從淡黃色尿到有血塊的紅色尿,透明或含有懸浮組織。總體積變化也非常大,從5到100ml。樣品的蛋白質濃度范圍從20|ig/mL到2mg/mL(150jag/mL是平均濃度)。要得到蛋白質濃度,樣品在水上被解凍并在4°C下2000xg離心5min。上清液用來確定蛋白質濃度。沉淀100|ig蛋白質的必要體積是根據蛋白質與15%w/v三氯乙酸(TCA)沉淀的效率為75°/。計算出的。其余尿樣再冷凍于-80°C并被保存用于進一步的2D電泳法(若需要)。在水上混合TCA和尿1個小時,然后在4°C下16000xg離心20min以獲得被沉淀的蛋白質小球。該小球用丙酮洗滌,在-20°C保存并且蒸發溶劑至干。要進行二維(2D)電泳法實驗,第一個維度是IEF(等電子聚焦),蛋白質按它們的電荷(pl)分離;第二個維度是SDS-PAGE,蛋白質按它們的分子量分離。要進行第一個維度,蛋白質干小球與450再水合化緩沖液(尿素7M,硫脲2M,CHAPS2%,IPG緩沖液2。/。,溴苯酚藍0.002%)在室溫下重新懸浮1小時。使用IPG緩沖液(Amersham,ref#17-600-88),以使IEF的pH在3-10的范圍。對IEF,Amersham的Ettan,IPGphor等電聚焦系統使用了下述制造商的說明。IEF在被固定的pH梯度下進行,稱為IPG條帶,購買自Amersham(ref#17-6002-45)。在30V下凝膠再J^合活化16小時后,已溶解的蛋白質聚焦于第一個維度的條帶中。然后電壓增加到8000V,強度不高于50iuA每塊凝膠。當電壓到達90000V小時,IEF完成。對于第二個維度,在實驗室中使用Amersham的EttanDALT12凝膠槽聚合出26x20cm12.5%的丙烯酰胺。在EttanDALT12大型垂直系統中跑凝膠,并按照制造商的說明書進行直到電泳前端離開凝膠。按照制造商的說明使用Amersham(17-1150-01)的染料試劑盒,用硝酸銀洗染凝膠。然后為了對蛋白質斑點(圖1A)進行隨后的圖像分析,凝膠被干燥并保存。有些尿樣跑了超過l塊的2D-凝膠。B.對凝膠上蛋白質斑點的分析掃描每塊凝膠以獲得用于圖像分析的斑點圖。使用來自非線性動力學(UK)的ProgenesisPG220軟件以300dpi(每英寸點數)格式和8bits/channel分析圖像文件。為了增加分辨率,分析在凝膠的不連續區域進行。每個區域,稱為A(圖1B),K(圖1C),R(圖1D)和S(圖1E),選擇最佳的凝膠并將其掃描用于圖像分析。ProgenesisPG220軟件將平面圖像的信息轉換成3D圖像,每個斑點的強度與個體尿中對應蛋白質的相對量有關。每塊凝膠中每個斑點的強度得自軟件表。這些原始數據是隨后統計分析的依據。對每個單獨的斑點進4亍統計分析并比較二個不同組中它的強度(例如,CV和Ta),必須證實這些數據是正態分布的。比較屬于二個組的斑點,要使用學生的t檢驗并得到p值這是評價一個亞組對另一個亞組斑點的理論誤差。僅選擇p值".05的斑點。這些斑點的倍數變化和平均率按下述任一種方法計算1)樣品的總斑點量,即理論總蛋白質濃度,或2)連續表達的蛋白質在每個樣品中恒定的量,或3)同樣樣品中二次差異表達的蛋白質。n值或樣品數量也被計算。比較對照病人的尿樣與來自已經被診斷為過渡膀胱癌的病人的尿樣,40種蛋白質在它們的倍數變化上顯示了統計學上的顯著性和穩定性。通過MALDI-TOF(介質輔助激光脫附/飛行離子化時間)光譜法識別這些斑點。那些2D電泳法顯示有統計學上顯著性斑點的尿樣,被再次送入2D電泳并斑點被從凝膠中切下。蛋白被消化并被MALDI-T0F光譜法分析。肽質量指紋圖鐠能識別40種蛋白質,即^吏別TTHY、ACY1、AKR1A1、ALD0B、ANXA4、BIEA、BLVRB1、CATDH、CATDK、C03、CPGL1、EN0A、FRIL、GDIB、GPX3、GSHB、GSTP1、IDHC、LMAN2、LY6G6E、MASP2、NADC、NAPSA、PA2G4、PARK7、PCBP1、PDC61、PPAL、P腿2、PT廳2、QPCT、SBP1、STIP1、TALDO、WDR1、AMY、AP0A1、GSN40、GSN80和RETBP(見表1)。因此,這40種蛋白質,已#皮_〖正明在BTCC病人診斷中是差異表達的,被作為對疾病的診斷、預后、監控和治療有重要價值的生物標記而識別。表l<table>tableseeoriginaldocumentpage39</column></row><table>細胞質非特異性二肽酶蛋白標、志序列ID號位點號GI聯M白OMIM蛋白名稱EN0A13R383R058R0544503571P06733172430(X-烯醇化酵14A519A524A53031873302FRIL15S444182516P02792134790鐵蛋白輕鏈GDIB16A499廳l6598323P50395600767RabGDP分離抑制劑PGPX317S777404108P22352138321血漿谷胱甘肽過氧化物酵GSHB18K72308248826P48637601002谷胱甘肽合成酶GSTP119S34620664359P09211134660谷胱甘肽好u轉移酶匿C20R11949168486075874147700細胞質異檸檬酸脫氮酶服N221K1187K7280K72925803023Q12907無完整囊泡膜蛋白VIP36前體LY6G6E22K735955961604Q5SRS9無'淋巴細l包^元原6復合體MASP223S77550513646000187605102甘露糖-結合凝集素絲氨酸蛋白胞腸C24K116614603130Q15274606248尼克酰胺乙酰乙酸水解酵<table>tableseeoriginaldocumentpage41</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage42</column></row><table>舉例,圖2顯示了二維電泳法(2D)凝膠的區域R中對應BIEA的斑點R211,得自一個健康個體尿樣(圖2A),患癌癥的在Ta階段患者的(圖2B),患癌癥在Tl低級階段患者的(Tl-LG,圖2C),患癌癥在Tl高級階段患者的(Tl-HG,圖2D)和患癌癥在T2階段患者的(圖2E)。能看到與健康尿樣相比,斑點R211的強度在不同階段的癌癥患者的樣品中明顯減少。這些區別在ProgenesisPG220軟件的統計分析后顯示有顯著性。圖3顯示了在樣品CV、Ta、Tl低度惡性(Tl-LG),Tl高度惡性(T1-HG)和T2中斑點R211的強度。每個小組的樣品數量如括號內所示。圖4顯示了不同尿樣中斑點R211的強度檢測的穩定性。這被表示為在被分析的每塊凝膠中持續出現或缺少斑點R211的凝膠的百分比。每個小組的樣品數量如括號內所示。表2顯示了癌癥不同階段的樣品與一個非癌個體的樣品相比較(CV),斑點R211的p和倍數變化統計分析值。斑點R211的倍數變化用每塊單獨凝膠的總斑點容量(TSV)標準化。表2<table>tableseeoriginaldocumentpage43</column></row><table>n.尿樣中發現的蛋白質的抗體展開測試可用的多克隆和/或單克隆抗體(或商業購買或用下述免疫協議產生)的反應性和敏感性,通常用于繪制被監測蛋白的標準("劑量反應")曲線。a.免疫協議1.多克隆抗體用標準方法學可提高多克隆抗血清以對抗特定蛋白質,例如那些數不清的已公開了的可利用的本領域通常使用的技術。在本實施例中,雄性新西蘭白兔用蛋白質制劑免疫,首先用Freund完全輔劑(Gibco,GrandIsland,紐約),然后三個月中每月用不完全的輔劑蛋白質。兔子血清和小鼠血清在融合前被用作多克隆抗血清并由標準免疫印跡技術證明是易與蛋白質制劑反應的。2.重組蛋白質的生產凝膠中找到的蛋白數量太低不足以引起免疫,因此使用pET28b(+)克隆載體在E.coli內表達。得到的前述粗提物(BoronatA.,etal.,J.Bacteriol.1981,147:181-85)在SDS-PAGE凝膠上跑膠。重組蛋白質被從凝膠中切下并釋放于丙烯酰胺中。為了生產對應重組蛋白質的抗體,釋放的蛋白質直接被用于上述免疫的兔子。B.免疫印跡實驗在上樣到6%聚丙烯酰胺凝膠前,蛋白質樣品(總蛋白質20jug)與補充了5%(3-巰基乙醇的SDS-PAGE凝膠上樣緩沖液混合并在100°C孵育5min。電泳后,蛋白質被轉移到硝化纖維素膜上。跑了復制凝膠并顯示斑點。一張膜證明了抗體對應著發明所選擇的40種蛋白質中的一種或多種(圣克魯斯生物科技公司,圣克魯斯,加州,美國)。當第二張膜證明了抗體對應著作為蛋白質上樣對照的肌動蛋白(Amersham,LittleChalfont,英國)。最終,膜和與過氧化物酶(Amersham)共軛的次要抗體雜交,并使用ECL系統(Amersham)與高性能化學感光膠片(HyperfilmECL,Amersham)才全測化學發光信號。III.用免疫印跡實驗檢驗尿檢樣品幾種生物標記用于盲法一企測40個尿樣包括a)沒有癌的(12個樣品)b)BTCC包括Ta(8個樣品),Tl-低度惡性(6個樣品),Tl高度惡性(6個樣品)和T2(8個樣品)。得到的敏感度、特異性和準確性的值如表3所示。使用這些公式計算敏感度、特異性和準確性的值(真陰性+真陽性)準確性=-^-樣品數量真陽性~(真陽性+fi陰性)真陰性特射生=_^_(真陰性4i陽性)例如,生物標記AMY顯示為敏感性89%,85%的準確性的值及其特異性為75%。表3<table>tableseeoriginaldocumentpage45</column></row><table>通過由這些實驗得到的數據進行二項式邏輯回歸,可獲得通常增加診斷方法的敏感性和特異性的生物標記的不同組合,如表4所示。表4<table>tableseeoriginaldocumentpage45</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage46</column></row><table>權利要求1、一種非侵入性的體外方法,包括a)檢測和定量存在于來自個體的一個尿檢樣品中的一種或多種生物標記;和b)比較a)中的尿檢樣品得到的表達測量值與正常尿的對應標準值,其中在a)得到的測量值與正常尿的對應標準值相比的變化指示了膀胱移行細胞癌。2、根據權利要求l的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括檢測和定量選自下組的一種或多種生物標記,該組為TTHY(SEQID1),ACYl(SEQID2),AKR1A1(SEQID3),ALDOB(SEQID4),ANXA4(SEQID5),BIEA(SEQID6),BLVRB(SEQID7),CATDH(SEQID8),CATDK(SEQID9),C03(SEQID10,SEQID11),CPGL1(SEQID12),ENOA(SEQID13,SEQID14),FRIL(SEQID15),GDIB(SEQID16),GPX3(SEQID17),GSHB(SEQID18),GSTPl(SEQID19),IDHC(SEQID20),LMAN2(SEQID21),LY6G6E(SEQID22),MASP2(SEQID23),NADC(SEQID24),NAPSA(SEQID25),PA2G4(SEQID26),PARK7(SEQID27),PCBPl(SEQID28),PDC6I(SEQID29),PPAL(SEQID30),PRDX2(SEQID31),PTD012(SEQID32),QPCT(SEQID33),SBPl(SEQID34),STIPl(SEQID35),TALDO(SEQID36),WDR1(SEQID37),AMY(SEQID38,SEQID39,SEQID40),AP0A1(SEQID41),GSN40(SEQID42),GS腦(SEQID43)和RETBP(SEQID44)或其轉錄或翻譯后變異。3、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括檢測和定量一種或多種生物標記選自TTHY,ACYl,AKR1A1,ALDOB,ANXA4,BIEA,BLVRB,CATDH,CATDK,C03,CPGL1,ENOA,FRIL,GDIB,GPX3,GSHB,GSTPl,IDHC,LMAN2,LY6G6E,MASP2,NADC,NAPSA,PA2G4,PARU,PCBPl,PDC6I,PPAL,PRDX2,PTD012,QPCT,SBP1,STIP1,TALD0和麵l或其轉錄或翻譯后變異。4、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括檢測和定量一種或多種生物標記選自TTHY,AMY,AP0A1,GSN40和GSN80或其轉錄或翻譯后變異。5、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括,險測和定量一種或多種生物標記選自AMY,APOAl,GSN40和GSN80或其轉錄或翻譯后變異,和一種或多種生物標記選自TTHY,ACY1,AKR1Al,ALDOB,ANXA4,BIEA,BLVRB,CATDH,CATDK,C03,CPGL1,EN0A1FRIL,GDIB,GPX3,GSHB,GSTP1,IDHC,LMAN2,LY6G6E,MASP2,NADC,NAPSA,PA2G4,PARK7,PCBP1,PDC6I,PPAL1PRDX2,PT歸2,QPCT,SBP1,STIP1,TALDO和WDR1或其轉錄或翻譯后變異。6、沖艮據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括;險測和定量一種或多種生物標記選自CATDH,CATDK,ENOA,GSHB,GSTP1,IDHC,PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后變異,和一種或多種生物標記選自ACY1,AKR1A1,ALDOB,ANXA4,BIEA,BLVRB,C03,CPGL1,FRIL,GDIB,GPX3,LMAN2,LY6G6E,MASP2,腸C,NAPSA,PA2G4,PARK7,PCBP1,PDC6I,PPAL,PT顧2,QPCT,SBP1:STIP1,TALDO,WDR1,AMY,AP0A1,GSN40,GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后變異。7、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括檢測和定量一種或多種生物標記選自TTHY,CATDH,CATDK,ENOA,GSTP1,I匿,MASP2,PRDX2,AMY,AP0A1,GSN40,GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后變異。8、根據權利要求2-7中任一項的非侵入性的體外方法,其中包括;險測和定量至少2種選自權利要求2中定義的生物標記。9、根據權利要求2-7中任一項的非侵入性的體外方法,其中包括檢測和定量至少3種選自權利要求2中定義的生物標記。10、根據權利要求2-7中任一項的非侵入性的體外方法,其中包括;險測和定量至少4種選自權利要求2中定義的生物標記。11、根據權利要求2-7中任一項的非侵入性的體外方法,其中包括檢測和定量至少5種選自權利要求2中定義的生物標記。12、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括檢測和定量生物標記AP0A1,GSN40和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異。13、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括檢測和定量生物標記AP0A1,GSN40,GSN80和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異。14、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括;險測和定量生物標記AMY,AP0A1,GSN40,GSN80和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異。15、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括檢測和定量生物標記CATDH,EN0A,GSTP1,MASP2,PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異。16、根據權利要求2的非侵入性的體外方法,其中步驟a)包括檢測和定量生物標記AMY,AP0A1,CATDK,EN0A,IDHC,PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異。17、根據權利要求1-16中任一項的非侵入性的體外方法,其用于檢測膀胱移行細胞癌的存在,用來確定該癌癥的階段或嚴重程度,評估外科切除術后疾病缺乏,建立該癌癥診斷和預后和/或監測對患有所述癌癥的個體的治療效果。18、根據權利要求1-17中任一項的非侵入性的體外方法,其中被分析的尿樣得自從前從未被診斷為膀胱移行細胞癌的個體。19、根據權利要求1-17中任一項的非侵入性的體外方法,其中被分析的尿樣得自從前已經被診斷為膀胱移行細胞癌的個體。20、根據權利要求1-17中任一項的非侵入性的體外方法,其中被分析的尿樣得自目前正在接受治療對抗膀胱移行細胞癌的個體。21、根據權利要求1-20中任一項的非侵入性的體外方法,其特征在于,蛋白質的檢測和量化包括笫一步,其中樣品蛋白質提取物依靠權利要求2的蛋白質或蛋白質的一個或更多表位與一種或多種特異性抗體相接觸,和第二步,定量所生成的抗體和蛋白質形成的復合體。22、根據權利要求21的非侵入性的體外方法,其特征在于,所述抗體是人源的,人源化的或非人源的和選自單克隆或多克隆抗體,抗體的整個或重組片段、組合抗體和Fab或scFv抗體片段。23、根據權利要求21或22的非侵入性的體外方法,其特征在于,在對所生成的抗體-蛋白質復合物的檢測和定量中,所用的技術選自下組免疫印跡、ELISA(酶聯免疫吸附分析),RIA(放射免疫分析),竟爭性EIA(竟爭性酶免疫分析),DAS-ELISA(雙重抗體夾心ELISA),免疫細胞化學或免疫組織化學的技術,根據生物芯片或包括特異性抗體的蛋白質微矩陣所使用的技術,根據月^:金沉淀以例如試紙的形式的分析;或通過親合色語法技術、配基結合分析或凝集素結合分析。24、根據權利要求1-23中任一項的非侵入性的體外方法,其中該方法用于監測藥學上或外科學上的功效。25、根據權利要求1-24中任一項的非侵入性的體外方法,其中該方法在膀胱移行細胞癌的評估中來自同一病人不同時間獲得的不同尿樣的蛋白質中的同一種或同一些蛋白質相比較用于檢測疾病的進程。26、衍生自尿液中存在的生物標記的一種或多種肽序列通過尿液分析以檢測膀胱移行細胞癌的存在,4企測該癌癥的階段或嚴重程度,評估外科切除術后疾病缺乏,建立該癌癥診斷和預后和/或監測對患有所述癌癥的個體的治療效果的體外用途。27、根據權利要求26的衍生自選自TTHY(SEQID1),ACY1(SEQID2),AKR1A1(SEQID3),ALD0B(SEQID4),ANXA4(SEQID5),BIEA(SEQID6),BLVRB(SEQID7),CATDH(SEQID8),CATDK(SEQID9),C03(SEQID10,SEQID11),CPGL1(SEQID12),ENOA(SEQID13,SEQID14),FRIL(SEQID15),GDIB(SEQID16),GPX3(SEQID17),GSHB(SEQID18),GSTP1(SEQID19),IDHC(SEQID20),LMAN2(SEQID21),LY6G6E(SEQID22),MASP2(SEQID23),NADC(SEQID24),NAPSA(SEQID25),PA2G4(SEQID26),PARK7(SEQID27),PCBP1(SEQID28),PDC6I(SEQID29),PPAL(SEQID30),PRDX2(SEQID31),PTD012(SEQID32),QPCT(SEQID33),SBP1(SEQID34),STIP1(SEQID35),TALDO(SEQID36),WDR1(SEQID37),AMY(SEQID38,SEQID39,SEQID40),AP0A1(SEQID41),GSN40(SEQID42),GSN80(SEQID43)和RETBP(SEQID44)或其轉錄或翻譯后變異的生物標記的一種或多種肽序列的用途。28、根據權利要求27的衍生自選自TTHY,ACY1,AKR1A1,ALD0B,ANXA4,BIEA,BLVRB,CATDH,CATDK,C03,CPGL1,ENOA,FRIL,GDIB,GPX3,GSHB,GSTP1,I匿,LMAN2,LY6G6E,MASP2,腸C,NAPSA,PA2G4,PARK7,PCBP1,PDC6I,PPAL,PRDX2,PTD012,QPCT,SBP1,STIP1,TALDO和WD或其轉錄或翻譯后變異的生物標記的一種或多種肽序列的用途。29、根據權利要求27的衍生自選自TTHY,AMY,APOAl,GSN40和GSN80或其轉錄或翻譯后變異的生物標記的一種或多種肽序列的用途。30、根據權利要求27的衍生自選自AMY,APOAl,GSN40和GSN80或其轉錄或翻譯后變異的生物標記的一種或多種肽序列,和衍生自選自TTHY,ACY1,AKR1A1,ALDOB,ANXA4,BIEA,BLVRB,CATDH,CATDK,C03,CPGL1,ENOA,FRIL,GDIB,GPX3,GSHB,GSTP1,IDHC,LMAN2,LY6G6E,MASP2,NADC,NAPSA,PA2G4,PARK7,PCBP1,PDC61,PPAL,PRDX2,PTD012,QPCT,SBP1,STIP1,TALDO和WDR1或其轉錄或翻譯后變異的生物標記的一種或多種肽序列的用途。31、根據權利要求27的衍生自選自CATDH,CATDK,ENOA,GSHB,GSTP1,IDHC,PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后變異的生物標記的一種或多種肽序列,和右t生自選自ACY1,AKR1A1,ALDOB,ANXA4,BIEA,BLVRB,C03,CPGL1,FRIL,GDIB,GPX3,LMAN2,LY6G6E,MASP2,NADC,NAPSA,PA2G4,PARK7,PCBP1,PDC6IPPAL,PTD012,QPCT,SBP1,STIP1,TALDO,WDR1,AMY,AP0A1,GSN40,GSN80和RETBP或其轉錄或翻譯后變異的生物標記的一種或多種狀序列的用途。32、根據權利要求27的衍生自選自TTHY,CATDH,CATDK,ENOA,GSTP1,IDHC,MASP2,PRDX2,AMY,APOAl,GSN40,GSN80和RETBP或其舉爭錄或翻譯后變異的生物標記的一種或多種肽序列的用途。33、根據權利要求27-32中任一項的用途,其中尿檢樣品中這些生物標記物的測定值與正常尿中的相對標準值相比的變化指示了膀胱移行細胞癌。34、根據權利要求27-32中任一項的至少2種肽序列的用途。35、根據權利要求27-32中任一項的至少3種肽序列的用途。36、根據權利要求27-32中任一項的至少4種肽序列的用途。37、根據權利要求27-32中任一項的至少5種肽序列的用途。38、根據權利要求27的衍生自AP0A1,GSN40和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異的肽序列的用途。39、才艮據權利要求27的書亍生自AP0A1,GSN40,GSN80和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異的肽序列的用途。40、根據權利要求27的衍生自AMY,AP0A1,GSN40,GSN80和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異的肽序列的用途。41、根據權利要求27的衍生自CATDH,EN0A,GSTP1,MASP2,PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異的肽序列的用途。42、根據權利要求27的衍生自AMY,AP0A1,CATDK,EN0A,IDHC,PRDX2和TTHY或其轉錄或翻譯后各自的變異的肽序列的用途。43、衍生自選自權利要求2中所定義的一系列蛋白質中的一種或多種的一種或多種核苷或肽序列,單獨的或聯合的,在篩選鑒定,發展和/或提高治療膀胱移行細胞癌的治療藥物的療效方法中的用途。44、一種實施如權利要求1-25中任一項定義的方法的試劑盒,包括1)至少一種特異性識別權利要求2的蛋白質的抗體和2)—種適于包裝的載體。45、一種根據權利要求44的用于檢測膀胱移行細胞癌的存在的試劑盒,用來確定該癌癥的階段或嚴重程度,評估外科切除術后疾病缺乏,建立該癌癥診斷和預后和/或監測對患有所述癌癥的個體的治療效果。46、一種根據權利要求44或45的試劑盒,包括一個生物芯片。47、一種根據權利要求46的試劑盒,其中生物芯片包括選自用于檢測權利要求2定義的系列中的蛋白質的抗體。全文摘要本發明涉及一種通過尿分析檢測個體的膀胱移行細胞癌的非侵入性體外方法,用于確定個體中這種癌癥的階段或嚴重程度或監測對患有這種癌癥的個體給藥的治療效果。文檔編號G01N33/68GK101300491SQ200680041276公開日2008年11月5日申請日期2006年10月10日優先權日2005年10月11日發明者伊瑪·瑞蒙斯·偌瑞古茲,克帕·埃斯克如瑞德·伽瑞克亞·卡得埃諾,勞瑞諾·斯蒙·布埃瑪,安娜·斯樂阿格·維樂克,安特尼諾·瑪瑞提茲·瑪瑞提茲,路易斯·何塞·凱斯崔樂·迪茲申請人:雷波瑞特瑞爾斯薩瓦特股份公司